CS5ではJavaScriptプログラムを制作、実行、デバッグできるExtendScript Toolkit CS5が付属しています。InDesign CS5からスクリプトを実行するだけでなく、ExtendScript Toolkitからも実行することができます。この場合、実行するアプリケーション名InDesign CS5を選択してから再生ボタンを押します。
ExtendScript Toolkit CS5でスクリプトを作成した場合、文字コードは自動的にUTF-8 (BOM:Byte Order Mark) になります。
スクリプト制作で不具合が発生した場合、ExtendScript Toolkit CS5を使ってデバッグすると解決が早いかもしれません。